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Un Señor del Tiempo misterioso y excéntrico conocido como El Doctor viaja a través del tiempo y el espacio en su máquina del tiempo, la TARDIS, que normalmente aparece desde el exterior como una cabina de policía de los años 1960. Con sus compañeros, explora el tiempo y el espacio, enfrentándose a una gran variedad de enemigos. Esta es la única temporada del Noveno Doctor, interpretado por Christopher Eccleston. Billie Piper es su primera y principal acompañante, Rose Tyler, quien arranca de la oscuridad en el planeta Tierra y que está cada vez más conectada al Doctor. También viaja brevemente con el joven prodigio Adam Mitchell, interpretado por Bruno Langley, y un poco más a largo plazo con un estafador del siglo LI y ex-agente del tiempo, el capitán Jack Harkness, interpretado por John Barrowman. El arco argumental de la temporada es la continua aparición en todas las épocas y lugares que visitan de la frase "Lobo malo". Las razones de estas apariciones y la identidad del lobo malo se revelan al final de la temporada.