Yukito Kunisaki est en voyage à la recherche de la jeune fille ailée qui a été liée au ciel il y a des siècles, après avoir entendu un vieux conte d'enfance de sa mère. Alors que Yukito montre son spectacle de marionnettes aux gens dans l'espoir de gagner de l'argent, il se retrouve dans une petite ville où il ne s'attend pas à rester très longtemps. Cependant, quand il rencontre une fille inhabituelle nommée Misuzu, les choses prennent un tour comme il est invité à rester avec elle.

En restant dans la ville pittoresque, Yukito devient bientôt amis avec les habitants. Au fur et à mesure qu'il apprend à mieux les connaître, il apprend de leurs problèmes et décide d'aider, mettant en attente sa recherche de Winged Maiden. Avec l'attachement à Misuzu et à la petite ville, Yukito pourra-t-il jamais trouver la Fille Ailée, ou est-ce plus proche qu'il ne le pensait?

"Never lose that strength or nobility, even when you grow up." When Utena was just a child and in the depths of sorrow, she found salvation in those words. They were the words of a prince, who bestowed upon her both a ring and the promise that it would lead her to him again. She never forgot the encounter. Now a teenager, Utena attends the prestigious Ohtori Academy; however, her strong sense of chivalry soon places her at odds with the student council and thrusts her into a series of mysterious and dangerous duels against its members.