U.C. 0097, one year after the opening of "Laplace's Box". Despite the revelation of the Universal Century Charter that acknowledges the existence and rights of Newtypes, the framework of the world has not been greatly altered. The conflict later dubbed the "Laplace Incident" is thought to have ended with the downfall of the Neo Zeon remnants known as the Sleeves. In its final battle, two full psycho-frame mobile suits displayed power beyond human understanding. The white unicorn and the black lion were sealed away to remove this danger from people's consciousness, and they should now be completely forgotten. However, the RX-0 Unicorn Gundam 03, which disappeared two years earlier, is now about to show itself in the Earth Sphere once more. A golden phoenix… named Phenex.

福井晴敏所创作（剪辑）的「U.C.ガンダムBlu-rayライブラリーズ」（宇宙世纪高达蓝光图书馆）特典视频，以∀高达的月光蝶开局，从拉拉辛、阿姆罗雷和的视角回顾UC历史，二人（魂）得出了月光蝶并非毁灭之光，而是重启新文明的生命光辉这一结论，是个寓教又娱乐的小故事特典视频。

U.C. 0096, three years after the end of the Second Neo Zeon War. The mysterious Vist Foundation attempts to hand over a certain secret to the Neo Zeon remnants known as the Sleeves. This will mean the opening of Laplace's Box, which holds a great secret tied to the origins of the Universal Century. The exchange is to take place at the manufacturing colony Industrial 7, home of the student Banagher Links. When Banagher rescues a girl who gives her name as Audrey Burne, he is drawn into the conflict surrounding Laplace's Box.

『シャアの反乱』から３年、ジオン共和国の自治権放棄を数年後に控え、一年戦争から続く戦乱の世は、表面上には平穏を取り戻しているかのように見えた。
工業コロニー〈インダストリアル７〉に住む少年バナージ・リンクスは、ある日、オードリー・バーンと名乗る謎の少女と出会う。
ビスト財団とネオ・ジオン残党組織『袖付き』による『ラプラスの箱』の取引を止めようと、単身行動を起こしたという彼女に対し、協力するバナージ。だが、同じく取引の阻止のため乗り込んだ地球連邦軍と『袖付き』との戦闘により、コロニーは戦場と化してしまう。
オードリーを探して戦火を走り抜けるバナージは、『ラプラスの箱』の鍵となる純白のモビルスーツ、ユニコーン
ガンダムとの運命的な出会いを果たす。
『ラプラスの箱』とは何か―。『箱』の抱く秘密とは何か―。今、宇宙世紀百年の呪いが解かれようとしていた。

『シャアの反乱』から３年、ジオン共和国の自治権放棄を数年後に控え、一年戦争から続く戦乱の世は、表面上には平穏を取り戻しているかのように見えた。
工業コロニー〈インダストリアル７〉に住む少年バナージ・リンクスは、ある日、オードリー・バーンと名乗る謎の少女と出会う。
ビスト財団とネオ・ジオン残党組織『袖付き』による『ラプラスの箱』の取引を止めようと、単身行動を起こしたという彼女に対し、協力するバナージ。だが、同じく取引の阻止のため乗り込んだ地球連邦軍と『袖付き』との戦闘により、コロニーは戦場と化してしまう。
オードリーを探して戦火を走り抜けるバナージは、『ラプラスの箱』の鍵となる純白のモビルスーツ、ユニコーン
ガンダムとの運命的な出会いを果たす。
『ラプラスの箱』とは何か―。『箱』の抱く秘密とは何か―。今、宇宙世紀百年の呪いが解かれようとしていた。

U.C.0096 ――。ネオ・ジオン軍と地球連邦軍が戦火を交えた『シャアの反乱』から3年。
開放されれば地球連邦政府を転覆しかねない、といわれる『ラプラスの箱』の譲渡を決意したビスト財団の宗主サイアムは、現当主のカーディアスに、ネオ・ ジオン残党軍の『袖付き』との会談を計画させる。だが、『箱』の流出阻止を企図した連邦政府は、特殊部隊エコーズとロンド・ベル隊を派遣。両勢力の戦闘は、工業コロニー〈インダストリアル7〉に惨禍を及ぼす。
今際の際のカーディアスから、『ラプラスの箱』の『鍵』となるモビルスーツ《ユニコ-ン》を託された 少年バナージ・リンクスは、『袖付き』のマリーダ中尉が駆る《クシャトリヤ》と交戦後、ロンド・ベルの強襲揚陸艦《ネェル・アーガマ》に拿獲されてしまう。その艦には、バナージの友人タクヤとミコットと共に、『箱』の譲渡を阻止しようとしてカーディアスと接触した少女オードリーも収容されていた。その《ネェル・アーガマ》に対し、単機で挑みかかるモビルスーツが出現する。《シナンジュ》と呼ばれる真紅の機体を駆る人物こそ、『シャアの再来』 の二つ名を持つ『袖付き』の首魁、フル・フロンタルだった―。
身为毕斯特财团家主的卡帝亚斯（Cardeas），在临终前将作为「拉普拉斯之盒」的钥匙的机动战士——独角兽托付给了年轻的巴纳吉。在与「袖章」驾驶员——玛莉妲·库鲁兹（Marida Cruz）和她的刹帝利（Kashatriya）交战后，巴纳吉被隆德·贝尔（Londo Bell）所属的攻击型登陆舰「拟·阿卡马（Nahel Argama）」所捕获。同样在舰上的还有巴纳吉的朋友拓也（Takuya）和米寇特（Micott）以及为试图阻止「盒子」的交接而与卡帝亚斯接触的少女——奥黛丽·本。 　　敌方的一台MS单独对「拟·阿卡马」发动了攻击。这台红色的MS就是新安州（Sinanju），而他的驾驶者弗尔·伏朗特（Full Frontal）——作为「袖章」的领袖，同时也是被称为“夏亚再世”的男人。 　　（2010.10.30 PSN在线配信 11.12正式发售BD&DVD）

巴纳吉为了保护米妮瓦，驾驶独角兽敢达出击，与弗尔･伏朗托的新安州在战斗时被捕获，囚于新吉翁残党军“带袖的”据点–资源卫星帛琉。为将夺回巴纳吉和独角兽，联邦军中率领特种作战部ECOAS的塔克萨中校，配合拟・阿卡马号，对帛琉发动袭击。 巴纳吉趁乱带着独角兽逃出了帛琉，然而… NT-D系统的启动揭示了通往“拉普拉斯之盒”的路标，因此弗尔･伏朗托派出了玛莉妲和她的刹帝力，挡住了巴纳吉的去路。

围绕着「拉普拉斯之盒」的战斗扩散到了地球，甚至连地球联邦政府的首都——达喀尔（Dakar）都正在遭受战争的恐怖。地球联邦政府的中心人物——罗南·马瑟纳斯（Ronan Marcenas）为了阻止「盒子」的开启而与隆德·贝尔的司令布莱特·诺亚（Bright Noa）接触。 　　与此同时，降落在地球的巴纳吉，正前往特林顿（Torrington）基地。在那里，有关「盒子」的新情报将被揭露。然而吉翁残党的愤怒将驱使MA尚布罗（Shamblo）的驾驶者罗妮（Loni）将战争变成了一场屠杀。 　　（2011.11.12 PSN在线配信 12.2 正式发售BD&DVD）

巴纳吉受到黑色的机动战士“报丧女妖（Banshee）”攻击后被监禁。在无路可逃的情况下，巴纳吉仍然坚持封印独角兽Gundam揭示的指向「拉普拉斯之盒」的新坐标，这样的他，让隆德贝尔队的司令布莱特看出了巴纳吉身上有历代Gundam驾驶员所显现的矜持与可能性，同时他向曾今与他共同战斗过的老朋友那里寻求帮助。 　　另一方面，从罗南引渡至玛莎（Martha）的米妮瓦，作为让巴纳吉能够听命行事的棋子被移送至超大型运输机「迦楼达（GARUDA）」上。围绕「盒子」的战斗移向高空并最终回到宇宙…（2012.5.19收费在线开始 6.8式发售BD&DVD）

由于弗尔·伏朗特的介入而得以逃离地球联邦军舰队追击的「拟·阿卡马」，被迫接受与「袖章」并肩作战。另一方面，伏朗特揭露了他用来对付联邦的密策并企图问出指向「拉普拉斯之盒」的下一个座标；而巴纳吉与米妮瓦，对他娓娓道出的未来竟是如此地冷酷无情感到毛骨悚然。此时，一艘联邦军的巡逻舰正在接近「拟·阿卡马」。究竟是要击沉巡逻舰呢？还是要毁弃与「袖章」之间的同盟呢…？在敌我双方夹缝间苦恼的巴纳吉一伙人，最后的选择是──。 　　（2013.3.2收费在线观看、剧场限定BD发售开始 3.22正式发售BD&DVD）

具备颠覆地球联邦政府可能性的“拉普拉斯之盒”的所在位置终于大白天下。 那就是一切事件的起始之地，工业7号的墨瓦腊泥加。毕斯特财团的现任领导者玛莎‧毕斯特‧卡拜因，为了保护财团的利益，和外甥亚伯特･毕斯特陪同地球联邦政府中心领导、移民评议会议长罗南･马瑟纳斯，直接前往夏延山军事基地，企图终结这次事件。 另一方面，为了追上率先行动的弗尔・伏朗托夺取“拉普拉斯之盒”，巴纳吉・林克斯迅速赶往工业7号，却被驾驶报丧女妖・命运女神型的利迪，以及驾驶罗森．祖鲁的安杰洛挡住了去路。 首先抵达“墨瓦腊泥加”，来到“盒子”守护者塞亚姆跟前的人，究竟会是……。