Professor Utonium and his son Ken are studying the strange Chemical X. When a mochi cake falls into the formula, it changes into Chemical Z. Ken fires a ray of Chemical Z at a glacier in Tokyo Bay, however that causes strange lights to scatter, some of them aim at three normal girls, Momoko, Miyako, and Kaoru. This gives them the power to transform into superheroes, the Powerpuff Girls Z!

Alors qu’un gigantesque vaisseau, le Turtle King, détruit une ville, l’organisation Galactor fait son apparition, dirigée par Berg Katse sous l’ordre du mystérieux Sosai X. Face à cette menace, le professeur Nambu active son plan secret : la Force G, ou Gatchaman, cinq jeunes héros aux pouvoirs uniques. À bord de leur vaisseau, ils partent affronter Galactor et livrent une première bataille décisive. Mais la guerre ne fait que commencer, et de nombreux mystères restent à percer, dont l’identité de Red Impulse et les véritables intentions de Sosai X.